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On désigne sous le nom de '''substance grise''' la partie des tissus du [[système nerveux central]] composée essentiellement des [[corps cellulaire]]s et de l'arbre [[Dendrite (biologie)|dendritique]] des [[neurone]]s ainsi que de certaines [[cellule gliale|cellules gliales]]. Au [[microscope (instrument)|microscope]], la substance grise apparaît plus sombre que le reste du tissu nerveux, dit ''[[substance blanche]]'', qui est essentiellement constitué des faisceaux de fibres [[axone|axonales]] gainées de [[myéline]], à la couleur blanchâtre.
Dans l'[[encéphale]], la substance grise est située en périphérie, c'est-à-dire autour de la [[substance blanche]]. De ce fait, on dit que la substance grise définit un [[cortex]] ("écorce" en grec ancien). Ce cortex est formé d'un empilement de couches de cellules nerveuses (entre 3 et 6 pour le [[cortex cérébral]] et 3 pour le [[cervelet|cortex cérébelleux]]) lesquelles se différencient par
Au niveau du [[tronc cérébral]], on retrouve aussi des noyaux de substance grise, notamment le [[tectum]], le [[tegmentum]], la [[substance grise périaqueducale]] ainsi qu'un certain nombre de noyaux des [[nerfs crâniens]].
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