-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathnohup.out
28237 lines (28225 loc) · 414 KB
/
nohup.out
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
program to calculate H Bond distribution during transition
2800 700888
2803 819608
2803 859688
2803 862848
2803 876148
2818 901308
2818 910908
2821 640948
2833 516328
2833 516728
2833 571048
2833 576748
2833 603768
2833 604728
2833 625528
2833 626148
2833 643008
2833 653688
2833 655428
2833 661308
2833 680528
2833 680768
2833 689408
2833 692168
2833 699388
2836 381200
2836 381680
2836 409800
2836 440400
2836 441520
2839 724368
2839 726648
2851 581528
2857 512068
2857 535408
2857 577268
program to calculate H Bond distribution during transition
2800 700888
2803 819608
program to create file for CV computing in transition state
2800 700937
Z_UP: 20.8211
Z_DOWN: 11.2711
X_UP: 53.4407
X_DOWN: 33.4407
Y_UP: 52.9517
Y_DOWN: 32.9517
2803 819537
2803 859930
2803 862867
2803 876125
2818 901398
2818 910809
2821 641096
2833 516485
2833 516711
2833 571789
2833 576752
2833 603705
2833 604747
2833 625444
2833 626071
2833 642923
2833 653646
2833 655417
2833 661358
2833 680447
2833 681124
2833 689333
2833 692092
2833 699399
2836 381284
2836 381666
2836 409895
2836 440340
2836 441535
2839 724289
2839 726893
2851 581558
2857 512382
2857 535345
2857 577252
2857 584754
2857 592938
2857 593043
2857 602034
2857 621452
2857 667502
2857 669927
2857 670368
2857 762234
2857 772602
2857 776210
2857 779731
2857 815668
2857 826424
2857 833808
2857 837402
2857 838127
2857 841859
2857 915731
2857 930427
2857 945722
2857 983387
2857 985184
2857 985630
2857 987459
2860 532189
2860 532575
2860 543922
2860 573277
2860 595782
2860 598012
2860 609166
2860 622456
2860 660354
2860 714931
2860 772936
2860 808076
2860 887550
2860 888489
2860 916274
2860 919995
2860 932553
2860 970498
2860 971757
2872 381051
2872 381486
2872 401116
2872 406695
2872 423596
2872 434451
2872 435579
2872 436293
2872 456080
2872 476049
2872 481203
2872 482765
2872 482915
2872 502314
2872 503795
2872 504376
2872 527736
2872 588107
2872 615512
2872 625701
2872 630008
2872 635844
2872 655685
2872 690197
2872 694000
2872 695517
2872 703576
2872 742918
2872 767139
2896 606899
2896 615638
2896 622624
2896 624039
2896 624568
2896 625273
2896 625399
2896 629502
2896 661298
2896 691221
2896 693827
2896 701389
2896 713348
2896 714736
2896 719932
2896 746403
2896 746895
2896 748301
2896 748717
2896 753144
2896 759084
2896 767689
2896 767953
2896 774786
2896 780472
2896 782732
2896 837559
2923 792398
2923 795431
2923 795597
2923 830596
2923 831676
2923 832138
2923 843966
2923 866308
2923 941107
2923 945735
2935 396455
2935 453645
2935 484348
2935 485892
2935 537534
2935 569503
2935 580041
2935 582028
2935 602429
2935 654756
2935 691597
2935 707672
2935 726093
2935 738511
2935 739365
2935 745223
2935 748734
2935 749439
2935 892742
2935 895371
2935 992630
2938 704786
2938 707816
2947 676637
2947 677612
2956 736863
2956 738964
2956 739442
2956 741764
2956 770846
2956 775104
2956 781227
2956 813532
2956 821888
2956 825403
2956 833451
2956 837378
2959 525946
2959 613309
2959 635250
2959 637497
2959 651394
2959 652171
2959 668152
2959 677733
2959 687578
2959 688599
2959 693023
2959 786481
2959 814840
2959 832961
2959 863730
2977 542226
2977 555366
2977 560093
2977 563396
2977 582537
2977 615423
2986 408104
2986 414964
2986 419539
2986 432578
2986 436090
2986 441459
2986 441655
2998 713956
2998 715281
2998 734617
2998 773757
2998 799097
2998 805157
2998 813314
2998 828626
2998 846394
2998 872104
2998 893964
2998 915470
2998 930893
2998 977395
2998 995487
2998 996002
3025 778567
3025 809708
3031 457542
3031 476679
3031 485122
3031 522685
3031 522973
3031 537172
3031 625807
3031 626294
3031 644892
3031 669110
3031 671611
3031 698908
3031 732478
3031 800341
3031 800927
3058 641888
3058 685707
3058 777937
3085 428898
3085 446487
3085 446830
3085 450140
3085 454946
3085 473567
3085 478136
3085 496300
3085 509132
3085 545853
3085 572067
3085 607258
3085 609596
3085 734381
3085 742109
3115 740004
3115 740687
3115 857902
3115 884455
3115 884554
3115 889154
3115 898231
3115 919778
3115 931689
3115 937654
3115 940019
3115 948828
3127 596948
3127 670512
3127 694186
3127 717256
3127 763898
3127 780726
3127 799002
3127 811071
3127 864794
3127 887731
3130 378585
3130 380188
3130 411410
3130 417869
3130 426685
3130 490496
3130 599090
3130 599753
3130 622362
3130 637795
3130 647630
3130 651952
3130 655820
3130 657983
3130 694181
3151 920231
3151 931521
3151 938242
3151 939713
3151 958651
3151 960024
3151 973631
3154 491867
3154 545163
3154 546811
3154 555395
3154 556689
3154 558702
3154 559008
3154 618478
3154 621428
3154 651077
3154 670369
3154 700826
3154 723545
3154 725779
3154 734767
3154 773368
3154 809067
3154 810362
3169 844850
3169 848568
3169 849580
3172 374309
3172 404235
3178 697468
3178 698816
3196 647977
3196 649503
3199 495779
3199 511963
3202 998978
3223 385506
3223 413070
3223 494605
3223 509673
3223 601266
3223 615948
3223 617819
3223 657927
3223 791950
3223 856701
3223 860180
3223 866888
3223 907160
3223 920418
3223 945710
3223 971938
3223 972098
3223 985317
3250 373039
3250 398171
3250 398759
3250 450287
3250 453848
3250 622179
3250 624660
3250 625445
3250 628178
3250 658099
3250 659778
3250 669097
3250 694708
3250 743278
3250 744064
3250 744971
3253 467429
3253 469128
3253 561233
3253 634361
3253 671582
3253 678923
3253 701315
3253 708917
3253 709098
3253 741282
3253 749969
3253 754133
3253 757690
3253 758069
3253 800583
3253 815593
3253 815962
3265 375099
3268 447401
3274 924374
3274 928344
3274 928652
3274 991170
3277 370718
3301 920083
3301 921127
3301 926353
3301 927372
3301 931047
3313 834106
3313 835281
3313 981735
3313 993742
3322 591503
3334 692512
3334 957637
3337 869004
3337 884996
3337 897068
3337 904125
3358 790749
3358 791082
3358 796393
3358 797583
3358 801371
3358 801968
3358 802488
3358 802623
3358 803327
3358 805509
3358 807575
3358 809098
3358 811435
3358 814374
3358 818946
3358 823924
3358 871209
3358 880950
3358 903308
3358 908691
3358 950156
3358 974978
3370 764368
3370 766598
3370 767943
3370 775435
3370 783163
3370 788759
3370 793432
3370 823336
3370 833412
3370 847870
3370 887008
3370 888499
3370 917177
3370 920275
3370 927958
3370 931321
3370 937846
3370 940178
3370 943399
3370 943705
3370 955993
3370 981482
3370 982390
3373 377239
3373 777602
3373 793738
3373 796251
3373 811472
3388 830623
3397 679547
3397 680286
3397 681498
3397 684226
3397 713443
3397 725526
3397 725693
3397 726363
3397 740967
3397 744211
3397 761696
3397 764313
3397 769296
3397 769847
3397 788600
3397 808497
3397 809207
3397 809821
3397 810549
3397 810694
3397 811093
3397 811331
3397 817374
3397 826834
3397 836623
3397 836877
3397 853684
3397 859947
3397 860317
3397 861585
3397 862083
3397 862728
3397 863644
3397 863902
3397 908235
3403 928018
3415 502150
3415 518752
3433 823461
3457 676263
3463 375578
3463 404958
3463 405406
3463 407231
3463 469585
3463 523989
3463 545601
3463 588659
3463 599989
3463 611512
3463 614083
3463 619028
3463 649985
3469 708403
3472 937086
3472 946658
3472 957804
3472 982214
3478 508179
3478 581919
3478 582293
3478 584808
3478 585178
3478 592358
3478 615061
3478 659274
3478 668907
3478 702683
3478 703023
3478 711999
3478 712123
3478 715235
3478 720062
3478 753717
3478 757275
3487 842923
3487 853605
3487 855397
3487 863913
3487 868731
3487 869928
3487 872157
3487 874166
3487 874903
3487 881088
3487 883731
3490 752397
3490 771287
3490 771759
3490 779538
3490 782332
3490 798540
3490 880394
3490 887955
3490 909991
3514 456040
3535 487254
3535 489593
3535 514009
3535 612497
3538 416534
3538 513427
3538 518071
3538 519307
3538 525465
3538 532633
3538 544643
3538 615552
3538 620627
3538 631868
3541 556408
3541 582390
3541 610727
3541 624314
3541 624513
3541 647140
3541 649024
3541 726418
3541 739378
3541 741555
3541 818917
3541 824903
3541 866573
3541 866818
3541 868792
3541 911715
3541 927191
3544 545042
3544 587602
3544 588613
3544 614162
3544 625014
3544 625887
3553 896482
3553 927789
3553 994515
3559 459043
3559 466502
3559 472205
3559 474065
3559 561517
3559 562818
3559 563984
3559 579098
3565 440547
3565 441046
3565 458930
3565 506550
3565 519917
3565 521098
3565 527144
3565 527419
3565 538624
3565 618822
3565 641509
3565 642534
3565 644051
3565 660995
3565 661839
3565 688401
3565 712424
3565 714522
3565 726776
3565 727410
3565 744332
3571 521018
3571 529497
3571 585888
3571 635342
3571 636100
3571 643207
3571 663503
3571 672909
3571 673603
3571 674012
3571 677986
3571 683059
3571 683184
3571 690339
3571 691044
3574 483961
3574 486189
3574 540473
3574 544484
3574 634587
3574 636816
3574 641896
3574 663075
3574 663641
3574 668233
3574 668377
3574 676852
3574 718759
3574 738919
3574 744011
3574 771078
3574 781417
3574 782860
3574 783043
3574 785735
3574 785951
3574 807718
3574 812404
3574 839509
3574 868252
3574 891658
3574 906088
3574 921905
3583 847867
3583 897745
3583 904312
3583 913078
3583 975462
3583 975743
3583 981529
3583 983793
3583 986229
3586 806064
3586 811472
3586 816587
3586 853750
3586 868976
3586 880005
3586 880617
3586 883195
3586 903937
3586 943699
3586 955061
3586 979303
3586 979836
3586 988262
3586 999001
3595 548689
3595 560273
3595 560938
3595 615149
3595 636294
3595 720357
3595 739125
3595 739409
3595 746283
3595 778957
3595 822368
3595 824988
3595 829017
3595 868245
3595 871149
3595 871592
3595 938953
3595 977458
3595 978419
3601 473713
3601 474259
3601 474460
3601 479331
3601 482073
3601 519129
3601 523999
3601 530173
3601 530816
3601 583677
3601 606371
3601 606841
3601 612851
3601 616820
3601 636612
3601 662323
3601 669058
3601 709682
3601 719112
3601 742295
3601 745817
3601 774000
3601 790470
3601 843470
3601 845921
3604 965077
3604 989398
3610 447179
3610 460013
3610 465066
3610 465262
3610 533300
3610 575242
3610 575823
3610 580313
3610 580756
3610 584364
3610 627089
3610 630901
3610 662658
3610 663828
3610 678842
3610 695866
3610 711744
3610 739213
3610 771328
3610 771677
3610 829884
3610 830604
3610 831357
program to create file for CV computing in transition state
2800 700937
Z_UP: 20.8211
Z_DOWN: 11.2711
X_UP: 53.4407
X_DOWN: 33.4407
Y_UP: 52.9517
Y_DOWN: 32.9517
2803 819537
2803 859930
2803 862867
2803 876125
2818 901398
2818 910809
2821 641096
2833 516485
2833 516711
2833 571789
2833 576752
2833 603705
2833 604747
2833 625444
2833 626071
2833 642923
2833 653646
2833 655417
2833 661358
2833 680447
2833 681124
2833 689333
2833 692092
2833 699399
2836 381284
2836 381666
2836 409895
2836 440340
2836 441535
2839 724289
2839 726893
2851 581558
2857 512382
2857 535345
2857 577252
2857 584754
2857 592938
2857 593043
2857 602034
2857 621452
2857 667502
2857 669927
2857 670368
2857 762234
2857 772602
2857 776210
2857 779731
2857 815668
2857 826424
2857 833808
2857 837402
2857 838127
2857 841859
2857 915731
2857 930427
2857 945722
2857 983387
2857 985184
2857 985630
2857 987459
2860 532189
2860 532575
2860 543922
2860 573277
2860 595782
2860 598012
2860 609166
2860 622456
2860 660354
2860 714931
2860 772936
2860 808076
2860 887550
2860 888489
2860 916274
2860 919995
2860 932553
2860 970498
2860 971757
2872 381051
2872 381486
2872 401116
2872 406695
2872 423596
2872 434451
2872 435579
2872 436293
2872 456080
2872 476049
2872 481203
2872 482765
2872 482915
2872 502314
2872 503795
2872 504376
2872 527736
2872 588107
2872 615512
2872 625701
2872 630008
2872 635844
2872 655685
2872 690197
2872 694000
2872 695517
2872 703576
2872 742918
2872 767139
2896 606899
2896 615638
2896 622624
2896 624039
2896 624568
2896 625273
2896 625399
2896 629502
2896 661298
2896 691221
2896 693827
2896 701389
2896 713348
2896 714736
2896 719932
2896 746403
2896 746895
2896 748301
2896 748717
2896 753144
2896 759084
2896 767689
2896 767953
2896 774786
2896 780472
2896 782732
2896 837559
2923 792398
2923 795431
2923 795597
2923 830596
2923 831676
2923 832138
2923 843966
2923 866308
2923 941107
2923 945735
2935 396455
2935 453645
2935 484348
2935 485892
2935 537534
2935 569503
2935 580041
2935 582028
2935 602429
2935 654756
2935 691597
2935 707672
2935 726093
2935 738511
2935 739365
2935 745223
2935 748734
2935 749439
2935 892742
2935 895371
2935 992630
2938 704786
2938 707816
2947 676637
2947 677612
2956 736863
2956 738964
2956 739442
2956 741764
2956 770846
2956 775104
2956 781227
2956 813532
2956 821888