TTBK1

TTBK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BTJ, 4BTK, 4BTM, 4NFM, 4NFN
Ідентифікатори
Символи	TTBK1, BDTK, tau tubulin kinase 1
Зовнішні ІД	MGI: 2147036 HomoloGene: 50342 GeneCards: TTBK1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • ATP binding • kinase activity • tau protein binding • tau-protein kinase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • microtubule associated complex • soma • perinuclear region of cytoplasm Біологічний процес • protein phosphorylation • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • substantia nigra development • фосфорилювання • regulation of cell shape • learning or memory • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • peptidyl-threonine phosphorylation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of protein binding • positive regulation of protein polymerization • positive regulation of astrocyte activation • positive regulation of microglial cell activation • positive regulation of cyclin-dependent protein kinase activity • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84630	106763
Ensembl	ENSG00000146216	ENSMUSG00000015599
UniProt	Q5TCY1	Q6PCN3
RefSeq (мРНК)	NM_032538	NM_001162864 NM_175351
RefSeq (білок)	NP_115927	NP_001156336
Локус (UCSC)	Хр. 6: 43.24 – 43.29 Mb	Хр. 17: 46.75 – 46.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TTBK1 (англ. Tau tubulin kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 321 амінокислот, а молекулярна маса — 142 737.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQCLAAALKD		ETNMSGGGEQ		ADILPANYVV		KDRWKVLKKI		GGGGFGEIYE
AMDLLTRENV		ALKVESAQQP		KQVLKMEVAV		LKKLQGKDHV		CRFIGCGRNE
KFNYVVMQLQ		GRNLADLRRS		QPRGTFTLST		TLRLGKQILE		SIEAIHSVGF
LHRDIKPSNF		AMGRLPSTYR		KCYMLDFGLA		RQYTNTTGDV		RPPRNVAGFR
GTVRYASVNA		HKNREMGRHD		DLWSLFYMLV		EFAVGQLPWR		KIKDKEQVGM
IKEKYEHRML		LKHMPSEFHL		FLDHIASLDY		FTKPDYQLIM		SVFENSMKER
GIAENEAFDW		EKAGTDALLS		TSTSTPPQQN		TRQTAAMFGV		VNVTPVPGDL
LRENTEDVLQ		GEHLSDQENA		PPILPGRPSE		GLGPSPHLVP		HPGGPEAEVW
EETDVNRNKL		RINIGKSPCV		EEEQSRGMGV		PSSPVRAPPD		SPTTPVRSLR
YRRVNSPESE		RLSTADGRVE		LPERRSRMDL		PGSPSRQACS		SQPAQMLSVD
TGHADRQASG		RMDVSASVEQ		EALSNAFRSV		PLAEEEDFDS		KEWVIIDKET
ELKDFPPGAE		PSTSGTTDEE		PEELRPLPEE		GEERRRLGAE		PTVRPRGRSM
QALAEEDLQH		LPPQPLPPQL		SQGDGRSETS		QPPTPGSPSH		SPLHSGPRPR
RRESDPTGPQ		RQVFSVAPPF		EVNGLPRAVP		LSLPYQDFKR		DLSDYRERAR
LLNRVRRVGF		SHMLLTTPQV		PLAPVQPQAN		GKEEEEEEEE		DEEEEEEDEE
EEEEEEEEEE		EEEEEEEEEE		EAAAAVALGE		VLGPRSGSSS		EGSERSTDRS
QEGAPSTLLA		DDQKESRGRA		SMADGDLEPE		EGSKTLVLVS		PGDMKKSPVT
AELAPDPDLG		TLAALTPQHE		RPQPTGSQLD		VSEPGTLSSV		LKSEPKPPGP
GAGLGAGTVT		TGVGGVAVTS		SPFTKVERTF		VHIAEKTHLN		VMSSGGQALR
SEEFSAGGEL		GLELASDGGA		VEEGARAPLE		NGLALSGLNG		AEIEGSALSG
APRETPSEMA		TNSLPNGPAL		ADGPAPVSPL		EPSPEKVATI		SPRRHAMPGS
RPRSRIPVLL		SEEDTGSEPS		GSLSAKERWS		KRARPQQDLA		RLVMEKRQGR
LLLRLASGAS		SSSSEEQRRA		SETLSGTGSE		EDTPASEPAA		ALPRKSGRAA
ATRSRIPRPI		GLRMPMPVAA		QQPASRSHGA		APALDTAITS		RLQLQTPPGS
ATAADLRPKQ		PPGRGLGPGR		AQAGARPPAP		RSPRLPASTS		AARNASASPR
SQSLSRRESP		SPSHQARPGV		PPPRGVPPAR		AQPDGTPSPG		GSKKGPRGKL
QAQRATTKGR		AGGAEGRAGA		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Sato S., Cerny R.L., Buescher J.L., Ikezu T. (2006). Tau-tubulin kinase 1 (TTBK1), a neuron-specific tau kinase candidate, is involved in tau phosphorylation and aggregation. J. Neurochem. 98: 1573—1584. PMID 16923168 DOI:10.1111/j.1471-4159.2006.04059.x
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6