MBD3

MBD3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MB7
Ідентифікатори
Символи	MBD3, methyl-CpG binding domain protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603573 MGI: 1333812 HomoloGene: 2917 GeneCards: MBD3
Онтологія гена Молекулярна функція • methyl-CpG binding • DNA binding • nucleosomal DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • histone deacetylase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0035328 Гетерохроматин • хромосома • NuRD complex • цитоплазма • Хроматин • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • response to estradiol • гістогенез • embryonic organ development • regulation of DNA methylation • in utero embryonic development • GO:1904578 response to organic cyclic compound • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • heart development • DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • histone acetylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0010260 старіння людини • brain development • response to nutrient levels • transcription, DNA-templated • regulation of signal transduction by p53 class mediator • histone deacetylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	53615	17192
Ensembl	ENSG00000071655	ENSMUSG00000035478
UniProt	O95983	Q9Z2D8
RefSeq (мРНК)	NM_003926 NM_001281453 NM_001281454	NM_013595 NM_001306143
RefSeq (білок)	NP_001268382 NP_001268383	NP_001293072 NP_038623
Локус (UCSC)	Хр. 19: 1.57 – 1.59 Mb	Хр. 10: 80.23 – 80.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MBD3 (англ. Methyl-CpG binding domain protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 844.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERKRWECPA		LPQGWEREEV		PRRSGLSAGH		RDVFYYSPSG		KKFRSKPQLA
RYLGGSMDLS		TFDFRTGKML		MSKMNKSRQR		VRYDSSNQVK		GKPDLNTALP
VRQTASIFKQ		PVTKITNHPS		NKVKSDPQKA		VDQPRQLFWE		KKLSGLNAFD
IAEELVKTMD		LPKGLQGVGP		GCTDETLLSA		IASALHTSTM		PITGQLSAAV
EKNPGVWLNT		TQPLCKAFMV		TDEDIRKQEE		LVQQVRKRLE		EALMADMLAH
VEELARDGEA		PLDKACAEDD		DEEDEEEEEE		EPDPDPEMEH		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins. Mol. Cell. Biol. 18: 6538—6547. PMID 9774669 DOI:10.1128/MCB.18.11.6538
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tatematsu K., Yamazaki T., Ishikawa F. (2000). MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase. Genes Cells. 5: 677—688. PMID 10947852 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x
• Saito M., Ishikawa F. (2002). The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2. J. Biol. Chem. 277: 35434—35439. PMID 12124384 DOI:10.1074/jbc.M203455200
• Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. (2002). Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3. J. Biol. Chem. 277: 40958—40966. PMID 12183469 DOI:10.1074/jbc.M207467200

Див. також

• Хромосома 19