Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ID3
Ідентифікатори
Символи
ID3 , HEIR-1, bHLHb25, inhibitor of DNA binding 3, HLH protein
Зовнішні ІД
OMIM : 600277 MGI: 96398 HomoloGene: 1633 GeneCards: ID3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• protein dimerization activity • leptomycin B binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• negative regulation of myoblast differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • epithelial cell differentiation • ритмічний процес • regulation of DNA replication • muscle organ development • notochord development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression • regulation of cell cycle • odontogenesis • multicellular organism development • heart development • central nervous system development • response to wounding • циркадний ритм • neuron differentiation • positive regulation of apoptotic process • metanephros development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to leptomycin B • negative regulation of DNA binding • negative regulation of neuron differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 23.56 – 23.56 Mb
Хр. 4: 135.87 – 135.87 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ID3 (англ. Inhibitor of DNA binding 3, HLH protein ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 119 амінокислот , а молекулярна маса — 12 999[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKALSPVRGC YEAVCCLSER SLAIARGRGK GPAAEEPLSL LDDMNHCYSR
LRELVPGVPR GTQLSQVEIL QRVIDYILDL QVVLAEPAPG PPDGPHLPIQ
TAELTPELVI SNDKRSFCH
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми, міогенез, поліморфізм.
Локалізований у ядрі .
Deed R.W., Hirose T., Mitchell E.L.D., Santibanez-Koref M.F., Norton J.D. (1994). Structural organisation and chromosomal mapping of the human Id-3 gene . Gene . 151 : 309—314. PMID 7828896 DOI :10.1016/0378-1119(94)90676-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Ward S.M., Fernando S.J., Hou T.Y., Duffield G.E. (2010). The transcriptional repressor ID2 can interact with the canonical clock components CLOCK and BMAL1 and mediate inhibitory effects on mPer1 expression. J. Biol. Chem . 285 : 38987—39000. PMID 20861012 DOI :10.1074/jbc.M110.175182
Ellmeier W., Aguzzi A., Kleiner E., Kurzbauer R., Weith A. (1992). Mutually exclusive expression of a helix-loop-helix gene and N-myc in human neuroblastomas and in normal development . EMBO J . 11 : 2563—2571. PMID 1628620
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші