Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MYF5
Ідентифікатори
Символи
MYF5 , bHLHc2, myogenic factor 5, EORVA
Зовнішні ІД
OMIM : 159990 MGI: 97252 HomoloGene: 4085 GeneCards: MYF5
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• somitogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • muscle organ morphogenesis • осифікація • positive regulation of muscle cell differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle cell fate commitment • muscle organ development • extracellular matrix organization • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of skeletal muscle fiber development • transcription, DNA-templated • regulation of cell-matrix adhesion • multicellular organism development • positive regulation of myoblast fusion • positive regulation of myoblast differentiation • muscle tissue morphogenesis • skeletal muscle cell differentiation • camera-type eye development • skeletal muscle tissue development • cartilage condensation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 80.72 – 80.72 Mb
Хр. 10: 107.32 – 107.32 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MYF5 (англ. Myogenic factor 5 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот , а молекулярна маса — 28 296[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDVMDGCQFS PSEYFYDGSC IPSPEGEFGD EFVPRVAAFG AHKAELQGSD
EDEHVRAPTG HHQAGHCLMW ACKACKRKST TMDRRKAATM RERRRLKKVN
QAFETLKRCT TTNPNQRLPK VEILRNAIRY IESLQELLRE QVENYYSLPG
QSCSEPTSPT SNCSDGMPEC NSPVWSRKSS TFDSIYCPDV SNVYATDKNS
LSSLDCLSNI VDRITSSEQP GLPLQDLASL SPVASTDSQP ATPGASSSRL
IYHVL
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин , міогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші