一、藍綠地方實力差距大，藍營氣勢低落
台南市傳統即為綠大於藍的政治結構，2008年以來的幾場選舉，兩黨差距呈現逐步擴大之勢，國民黨幾乎是屢戰屢敗，使其在台南市的氣勢相當低落。去年底的五都選舉普遍便被認為是一場安靜的選戰，當時，民進黨賴清德被認為是「躺著就當選」，國民黨籍的郭添財則是「躺著不用選」。
此外，在國民黨中央推動改革下，其與地方派系勢力保持一定的距離，再加上缺乏與地方人士的溝通及互動，引發地方基層的不滿。過去，國民黨在台南市議會尚享有多數優勢，但在多名黨籍市議員集體退黨之後，國民黨在地方的實力幾近瓦解。
二、諸多不利條件惡化藍營的劣勢
除了先天不利條件之外，這次的立委選戰中，尚有一些因素惡化國民黨的處境，包括：
（一）馬總統多項針對台南市的政績未能落實，引發台南民眾不滿，其中，廢除白河、新市收費站的問題，更是成為民進黨攻擊的焦點；
（二）國親未能合作，弱化藍營戰力；目前，親民黨在台南市第一選區推出李宗智，但國民黨同時打算徵召前南縣副議長陳宗興，藍營的分裂使選情更為不利；
（三）人選確立過慢，並引發黨內部份人士的不滿：截至目前為止，在台南市五個立委選區中，國民黨正式提名的只有第四和第五選區的蘇俊賓和李全教，此對於選區的經營甚為不利。其他選區部分尚少未確定。其中，國民黨傾向在第一選區徵召陳宗興，但一來尚未確定，二有國親合作的問題，情勢仍不明朗；在第二選區，先前雖有前南縣副議長（周賜海）表達參選之意，但目前仍未確定人選；至於，第三選區，議員謝龍介雖有參選意願，但同時也表示「成功不必在我」；第四選區，由於之前有查名邦領表登記，但最後黨中央卻提名蘇俊賓，導致查名邦大呼不滿，批評刺客先刺到自己人。
（四）組織戰漸難發揮功能：有一派論者認為，縣市合併之後，地方派系的影響力大為下降，此使傳統上較為擅長的國民黨情勢更嚴峻。
（五）立委總統合併選舉變數大：不論是母雞帶小雞或是小雞拱母機的效果，合併選舉若能彼此加分，對兩者的選情皆有利；惟總統選舉屬於全國性、而立委選舉是使地域性，再加上國民黨的執政成績、黨與馬總統個人的形象等早已是民進黨攻擊的重心，這些都可以使立委選情更加艱困。
三、民進黨掌握多項優勢，內部整合尚稱成功
相對於國民黨的劣勢，民進黨在台南市立委選舉中掌握多項優勢，包括：（一）地方執政優勢，尤其，改制後，市長掌握的資源更多，相當有助於平日的經營；（二）現任優勢，民進黨幾位被提名人多是現任立委，且具知名度，長期在地方經營，相當具有優勢；（三）民進黨一度在第五選區提名上出現分裂，引發黨內派系風暴，不論是批評民調不公的李俊毅（謝系）或是贏得民調卻未被提名的王定宇（一邊一國連線），在黨中央徵召大老陳唐山之後，應可暫時平息黨內紛爭；惟人在獄中的陳水扁批判李俊毅的發言是否會引發另一波派系紛爭，值得觀察。
綜上述，目前國、民兩黨在台南市立委選舉的情勢有大幅的差距，惟距離尚有半年的時間，而且，國民黨的部分劣勢也不必然是劣勢，包括：
（一）相較於民進黨提出老面孔候選人，國民黨推出刺客或許可讓民眾看到國民黨深耕南部的用心，尤其，其給年輕人一個機會的意涵，若對照民進黨在提名過程中的派系對立，或許可以讓台南市民感受到一股清流；
（二）勝選靠的還是政見，未來候選人能否提出符合民眾期待的政見才是關鍵，以目前來看，兩黨最大的不同或許是在兩岸政策上；其中，賴清德市長從反對兩岸開放，到現在批評台南機場無固定定航班卻只有包機，也可看出這塊是國民黨候選人未來可著力之處；同時，國民黨必須針對未能落實的政見給民眾一個交代，並規劃未來的藍圖，如此才能贏得民心。
（三）國親兩黨能否合作則是能否扭轉情勢的另一關鍵。
（四）與地方人士加強溝通，取得有利人士的支持。
（五）由於國民黨在台南目前的氣勢較弱，若能推出一位領導型的候選人，或許可以帶動整體選戰氣勢，透過團體戰，拉抬聲勢。
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